Isomeren zijn stoffen met dezelfde molecuulformule, maar verschillende chemische structuren en activiteiten. U kan hebben geleerd dat er drie basistypen van isomeren — structurele en geometrische isomeren en enantiomeren — wanneer eigenlijk zijn er slechts twee soorten (structuurfondsen en stereoisomer) en verschillende subtypen. U kunt vertellen ze elkaar door hun hechting-patronen en hoe deze drie-dimensionale ruimte innemen.
Structurele (constitutionele) isomeren worden geïdentificeerd door hun hechting patronen. De atomen van de verbindingen zijn hetzelfde, maar ze zijn aangesloten in een zodanige wijze dat het maken van verschillende functionele groepen. Een voorbeeld zou zijn n-butaan en isobutaan. N-butaan is een rechte koolwaterstof keten met vier koolstofatomen terwijl isobuteen is vertakt. Het bestaat uit een rechte koolwaterstof keten met drie koolstofatomen en een methylgroep afkomstig uit de middelste koolstof.
Stereo-isomeren identificeren door hun plaatsing in de ruimte; de verbindingen hebben dezelfde atomen en bindingen patronen maar anders geregeld zal worden in de driedimensionale ruimte. Geometrische isomeren zijn eigenlijk een soort van configurationele stereoisomer.
Let op of de isomeren hebben beperkte rotatie rond een obligatie, zoals een dubbele binding. Dit zijn de geometrische isomeren. Zij zullen cis-trans verschillen hebben over hun beperkende obligaties — wat betekent tegenover plaatsing van functionele groepen of atomen aan weerszijden van de obligatie.
Vaststellen of de isomeren hebben tetrahedral centers (met vier verschillende groepen en/of die voortvloeien uit een centrale koolstof atomen). Dit zijn een subtype van isomeer een optische stereoisomer, die vervolgens kan worden geïdentificeerd als een enantiomeer of Diastereomeer genoemd. Als de isomeren nonsuperimposable spiegelbeelden van elkaar zijn ze enantiomeren; Als ze nonsuperimposable nonmirror beelden van elkaar zijn ze diastereomeren.