Boom schimmels komen in vele verschillende vormen en maten, en niet alle soorten schimmels die worden gevonden op een boom zijn parasitaire. Toch schimmels zijn verantwoordelijk voor veel ziekten van de boom en sommige van de meest virulente soorten boom ziekten zijn onzichtbaar voor het blote oog.
Plank schimmels
Plank schimmels (ook wel bracket schimmels genoemd) kan worden gevonden op levende bomen groeien. Ze lijken op planken of beugels en ze kunnen blijven jarenlang meegaan op een boom en een houtachtige vorm aannemen. Na verloop van tijd kan deze groei van de schimmels schadelijk zijn voor de boom.
Miniatuur schimmels
Soms kan een schimmel organisme zeer klein en nauwelijks zichtbaar worden. Vaak kunnen deze micro-organismen worden de meest destructieve. Een roest is een dergelijke soort van parasitaire schimmel die kan besmetten veel bomen in een uitbraak.
Kastanje bacterievuur
Misschien de meest destructieve plantenziekten geweest de kastanje blight schimmel, een ander microscopische schimmel die infecteert de kastanje bladeren, stam en takken, maar niet de root systeem. Als gevolg daarvan het bos is gevuld met vele kastanje aanplant, maar de boom is aangevallen door de virulente schimmel voordat het zaden produceren kan.
Iepziekte
Deze destructieve ziekte van het statige Amerikaanse elm wordt veroorzaakt door een kleine schimmel die wordt vervoerd door de schors door. Hoewel niet als de destructieve als de plaag van de kastanje (er zijn enkele overlevenden elm), de Amerikaanse elm niet langer in het bos als een concurrerende soorten groeien kan.
De boom als een microklimaat
Op sommige plaatsen zoals het Kruis van een filiaal of een verdeelde boomstam, zal een kleine micro-klimaat en levende omgeving ontwikkelen die de groei van champignons en andere soorten schimmels kunnen ondersteunen. Vaker wel dan niet deze schimmel groei is niet destructief voor de boom.