De Middellandse Zee is omringd door 20 landen met meer dan 400 miljoen mensen wonen in de omliggende regio's. Echter worden alle dieren van de Middellandse Zee blootgesteld aan ernstige bedreigingen om verschillende redenen. Het gaat hierbij om overbevissing, en een aantal van de vis die wordt gedood als onbedoelde bijvangst, waartoe ook walvissen en dolfijnen. Menselijke activiteiten op het gebied is bovendien verantwoordelijk voor het onderwerpen van dieren aan botsingen met schepen, vernietiging van habitats, geluidsoverlast en verontreiniging veroorzaakt door plastics en chemicaliën.
Onechte karetschildpad
De vleesetende loggerhead-schildpad is de meest voorkomende schildpad van de Middellandse Zee. Een van de grootste van de Chelonia zeeschildpadden, draagt de roodachtig bruin onechte meer van de encrusting organismen, zoals zeepokken, op zijn schelp dan andere mariene schildpad. Over grote afstanden trekkende, de onechte karetschildpad is bekend dat sommige van de langste ritten van alle soorten van de zee schildpad hebben gemaakt. Trekkende heeft ondernomen de turtles onderworpen aan toevallige vangen in de netten van's werelds visserij.
Haaien en roggen
Verschillende soorten haaien en roggen worden aangetroffen in de Middellandse Zee. Het gaat hierbij om de haai mako shortfin (Isurus oxyrinchus), de probeagle haai (Lamna nasus), de reus devil ray (Mobula mobular) en de zeebodem-knuffelen Maltese ray, ook bekend als de Maltese skate (Leucoraja melitensis). Echter, de grote witte haai (Carcharodon carcharias) is onder de 30 soorten haaien en roggen bedreigd voor uitsterven, volgens de website van National Geographic.
Mediterrane monniksrob
De Mediterrane monniksrob (Monachus monachus) is een van de zeldzaamste dieren op aarde. Het zegel heeft een uniforme bruin lichaam met een lagere onderkant thats een geelachtig wit. De naam van het zegel komt van het feit dat haar kleur lijkt op die van een monk's gewoonte. Monniksrobben maximaal 400 ponden wegen en leven tussen 20 tot 30 jaar. Zijn dieet bestaat uit octopus, weekdieren en vis. De monniksrob is de meest bedreigde soorten voet fin met waarschijnlijk minder dan 400 resterende op aarde, volgens de World Wildlife Federation.
Walvissen en dolfijnen
Ongeveer 20 verschillende soorten walvissen en dolfijnen worden aangetroffen in de Middellandse Zee met acht soorten worden bewoners. Het gaat hierbij om de potvis, orca, tuimelaar en de dolfijn. De gewone dolfijn, eens de meest voorkomende soort dolfijn in het Middellandse-Zeegebied, nu wordt geclassificeerd als bedreigd, volgens de walvissen en dolfijnen Conservation Society.
Mariene vissen
Vis in de Middellandse zee gevonden omvatten commerciële soorten zoals, zeebaars (Dicentrarchus labrax), heek ((Merluccius merluccius), blue fin tonijn (Thunnus thynnus) en dusky grouper (Epinephelus marginatus). Echter zijn de vissen alle met uitsterven bedreigd, volgens de International Union for Conservation of Nature-website. Er zijn meer dan 40 soorten vis in de Middellandse Zee, die in de komende jaren met 12 soorten knokige vissen ook met uitsterven bedreigd kan verdwijnen.
Kogelvissen
De giftige pufferfish (Lagocephalus sceleratus) is een van de meer dan 900 soorten buitenaardse vis die in de afgelopen decennia zijn gevonden in de kustgebieden van de oostelijke Middellandse Zee. De invasie is het veranderen van de hele voedselketen, volgens de website Physorg. De voltooiing van het Suezkanaal in 1869 gemaakt een corridor waardoor de verspreiding van uitheemse soorten in de Middellandse Zee. De impact van uitheemse soorten staat bekend als biologische verontreiniging.