Een fylogenetische boom is een grafische weergave van evolutionaire relaties die aantoont hoe organismen kunnen eventueel uit een gemeenschappelijke voorouder hebben afweek. Eerder, dit werd gedaan door vergelijking van de anatomie en fysiologie van levende organismen en fossielen, maar genetische informatie ontleend aan DNA nucleotidesequenties wordt nu vaak gebruikt. Organismen met enkele overeenkomsten kunnen worden gevonden op de aparte "takken" van een fylogenetische boom en mensen met specifieke gemeenschappelijkheden op "twijgen" van dezelfde tak zou bevinden. Een fylogenetische boom is een methode voor het begrip soorten en evolutionaire veranderingen in organismen.
Wat die u nodig hebt
- Gegevensset (dat wil zeggen, nucleotidesequenties, organisme foto's)
- Aanplakbord
- Lijm
- Pen
- Computer (voor geavanceerde nucleotide sequentie procedures alleen)
Selecteer een modelorganisme voor relatie vergelijking. Dit kan worden gedaan met een soort, ras of nucleotide sequentie die vertegenwoordigt van een organisme. Een organisme voorbeeld zou een koe. De rest van de tree zou aantonen hoe nauw gerelateerde een koe is op andere organismen die op basis van genetische eigenschappen.
![]()
Kies een outgroup. Een outgroup is een minder nauw verwante organisme of de enorm verschillende nucleotide sequentie. Als de model-organisme een koe is, zou een mogelijke outgroup een vis. De andere twee organismen zijn de verder naar beneden op de fylogenetische boom zullen hun uiteenlopende vertakkingspunt. Tijd is vertegenwoordigd met de vroegste datum aan de onderkant van de grafiek en de huidige dag wordt boven aan de grafiek. De plaatsing van de takken toont ongeveer als in het verleden een evolutionaire Trek eventueel gewijzigd een voorouderlijke organisme in verschillende soorten.
![]()
Een verzameling kenmerken te gebruiken voor vergelijking bepalen. Voorbeelden zijn "heeft vier poten," "kauwt cud," "geeft live geboorte" of "groeit haar." Nucleotidesequenties zijn gewoon alfabetische representaties van DNA die kenmerken, bepaalt dus een andere optie zou zijn: "bevat de opeenvolgende ATGGACACGGA."
![]()
Verdelen van organismen gebaseerd op de kenmerken. Wanneer een organisme niet de gewenste eigenschap bevat, bestaat een tak in de fylogenetische boom. Voor de characterisitic zou "heeft vier poten," koeien, schapen en herten alle op één branch, terwijl vis op een aparte tak zijn zou. Plak de afbeelding of de volgorde van een koe in de bovenhoek van het Aanplakbord en de vissen in de tegenoverliggende hoek en hen twee lijnen trekken aan de basis van het papier in een snijdende V-vorm.
Blijven scheiden van de modelorganismen of nucleotidesequenties totdat elk voorbeeld een enkele scheiding van de tak in een takje heeft. Het kenmerk "heeft wol" zou het scheiden van schapen van herten en koeien op een enkelvoud tak. Plaats de installatiekopie van de schapen in de buurt van het beeld van de vis en teken een lijn die in een V-vorm naar de tak van de koe verbindt. Met behulp van het kenmerk "heeft pluizige staart" zou bakenen koe van herten. Plak de afbeelding van het hert tussen de koeien en schapen en een andere lijn tekenen in een V-vorm die boven de vis en schapen lijnen snijdt. Bij elke soort één enkel bijkantoor heeft, is de fylogenetische boom voltooid.
![]()
- Kies een eindige verzameling van organismen of sequenties.
- Kies kenmerken of sequenties die het verdelen van de organismen in aparte groepen.
- Hebben meerdere karakteristieke ondersteunt om aan te tonen van organisme relaties.
- Fylogenetische plaatsing kan worden besproken op basis van vele kenmerken, en veel steun nodig voor plaatsing keuzes is. Wiskundige vergelijkingen mogelijk om aan te tonen van de statistische waarschijnlijkheid van evolutionaire veranderingen. Waarschijnlijkheid van divergentie op het genetische niveau laat ruimte voor mogelijke onjuistheden in de fylogenetische bomen.
