Zoutwater ecosystemen "make-up het grootste aquatisch systeem op de planeet, die betrekking hebben op meer dan 70 procent van het aardoppervlak," volgens de Amerikaanse Environmental Protection Agency (EPA). Zoutwater ecosystemen bieden voedsel en andere economische middelen zoals het toerisme. Zoutwater ecosystemen zijn gekomen onder stress in de afgelopen decennia naarmate de wereldbevolking toeneemt en de toestand van het milieu vermindert.
Mariene wetlands zijn "tijdelijke gebieden" tussen de Oceaan en de kust land, volgens de U.S. Geological Survey. Zoutwater wetland-ecosystemen omvatten mangroves en moerassen. Organismen aangepast aan het leven in wetlands habitats deel van hun leven buiten het water leven en zich moeten aanpassen aan een cyclus van veranderende zoutgehalte van het water. Mangrovebomen zijn essentieel voor de mariene ecosystemen langs de kust. Volgens de US Fish and Wildlife Service voorzien mangroven in habitats talrijke organismen; haven nesten plaatsen en foerageren gronden voor vogels, reptielen en zoogdieren; buffer stormen door functioneren als wind-einden en verbijsterend Golf actie met hun wortels; en filteren van het water door het vangen van sedimentatie en detritus in hun wortels. Zoutwater moerassen optreden in beschermde gebieden langs de kust en bieden veel van de dezelfde voordelen van de mangrove habitats. In plaats van Mangrovebomen domineren kruidachtige planten en grassen zoutwater moerassen.
Estuaria zijn een andere belangrijke mariene ecosysteem waar zout water en zoet water meet om een brakke mix. Volgens de National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA) bieden estuaria"habitat voor meer dan 75 procent van de Amerikaanse commerciële zee vangst," met inbegrip van krabben, mosselen, oesters, garnalen en andere vissoorten. Estuaria bieden ook een belangrijke habitat voor vogels, zoogdieren, reptielen, amfibieën en insecten en estuarium vegetatie helpt bij de afvoer van de filter en andere verontreinigende stoffen. Aangezien de meeste water uit het land naar de Oceaan via estuaria wegloopt, is potentieel voor vervuiling echter hoog. Verontreiniging vermindert estuarium ecosystemen en de effecten van de mensen die afhankelijk zijn van estuaria voor voedsel.
"Koraalriffen zijn tot's werelds rijkste ecosystemen, tweede alleen voor tropische regenwouden in plantaardige en dierlijke diversiteit," aldus de EPA. Tropische koraalriffen optreden in ondiepe warme wateren, typisch voor de kust van een land massa of in gebieden waar de eilanden eens bestond. Koralen riffen zijn fragiele ecosystemen die gevoelig voor de onevenwichtigheden in de water kwaliteit en habitat soorten zijn. Coral reef voedsel webs beginnen met algen, die de primaire bron van energie in het rif. Koralen en andere filter feeders afhankelijk van plankton — een vorm van algen — en detritus. Grotere rif soorten koralen afhankelijk als een bron van voedsel en voor bescherming en koraalriffen bieden een beschermde paai- en broederij ruimte voor veel belangrijke vissoorten.
De open oceaan, hierna aangeduid als de "pelagische zone," is het grootste mariene ecosysteem, volgens de nationale Earth Science Teachers Association (NESTA). Hoe verder de oceaan strekt zich uit van de kust, hoe meer de diepte toeneemt. Diep, open oceaan ecosystemen minder voedingsstoffen, minder licht ontvangt en kouder dan in de buurt van de wal habitats. Biomassa vermindert en stromingen te verhogen als de verhoging van de diepten van de Oceaan. De open oceaan is de thuisbasis van microscopische zwevende plankton en ook ondersteunt grote zeezoogdieren en knokige vissen met de volgende aanpassingen: gestroomlijnd organen en gespecialiseerde drijfvermogen functies voor lange afstand zwemmen en sonar of goed zicht voor de jacht in het donkere water. De grote vissen van de open oceaan zijn een belangrijke voedselbron voor de mens en zijn tonijn, zwaardvis en haaien.