Wanneer mensen van knaagdieren denken, zijn muizen wat gewoonlijk voor de geest komt. Er zijn echter meer dan 2.000 soorten knaagdieren. De gemakkelijkste manier om te identificeren van de soorten knaagdieren is door de subfamilies, zoals Sciumorpha (eekhoorn-achtige), Myomorpha (rat-achtige), Hystricomorpha (stekelvarken-achtige) en Castorimorpha. Deze vier soorten knaagdieren worden ingedeeld volgens hun skelet, specifiek de vorming van de kaak en de tanden.
Sciuromorph knaagdieren worden gekenmerkt door de vorm van hun kaakspieren kanaal, gelegen in de maxilla of bovenkaak. De Lewis-Clark State College website verklaart dat bij sciuromorph de knaagdieren, de mediale kauwspieren spier, die knaagdieren helpt bij het kauwen van voedsel, niet via het kanaal van de kaakspieren, in tegenstelling tot andere soorten knaagdieren doorgeeft. In plaats daarvan, de mediale kauwspieren is aangesloten op de tribune, of snuit. Meer dan 300 soorten sciuromorph knaagdieren leven in de wereld, volgens de website Bio Kids. Deze knaagdieren zijn eekhoorns, chipmunks, Prairiehonden, woodchucks en marmotten. Sciuromorph knaagdieren zijn omnivoor, wat betekent dat ze eten zowel planten als dieren, of ze zijn herbivore, eten alleen planten.
Meeste knaagdieren behoren tot de suborde Myomorpha, waarin meer dan 1.500 soorten, vertegenwoordigen 38 procent van alle zoogdieren, volgens Bio Kids. Myomorph knaagdieren omvatten ratten, hamsters, muizen, gerbils en lemmings. Myomorph knaagdieren worden geïdentificeerd door hun kaak en tanden structuur. De laterale en mediale kauwspieren, gebruikt in de kauwspieren, naar voren verplaatst. Omdat hun kaken en tanden uitsteken, zijn myomorph knaagdieren zeer gevoelig voor het knagen. Een myomorph knaagdier de mediale kauwspieren passeert de oogkassen, een uniek kenmerk van de zoogdieren. Myomorph knaagdieren leven in meeste habitats over de hele wereld, met uitzondering van Nieuw-Zeeland en Antarctica.
Gevonden in Zuid-Amerika, Noord-Amerika, Afrika en Azië, hystricomorph knaagdieren meer dan 230 soorten omvatten, staat Bio Kids. Grote knaagdieren zoals capybaras en oude wereld stekelvarkens zijn opgenomen in dit type. Andere hystricomorph knaagdieren zijn cavia's, neusberen, naked mole rats, dieren en chinchilla's. Alle deze knaagdieren zijn herbivoren, eten voornamelijk bladeren. Hystricomorpha knaagdieren hebt vergroot kaakspieren foramens, die aan het eind van het kanaal van de kaakspieren in de bovenkaak.
Zesennegentig soorten gophers, bevers en kangoeroe ratten make-up de onderorde castorimorpha. Deze knaagdieren gevonden in North, Zuid- en Midden-Amerika en Europa, en eten kleine insecten en zaden. Gophers zijn gravende knaagdieren die in ondergrondse tunnels in voornamelijk West Noord-Amerika leven. Kangaroo ratten, bekend om hun springen en grote voeten, leven in droge gebieden zoals woestijnen, waar ze vertrouwen op diepe holen om hen te beschermen tegen de zon. Voornamelijk actief in de nacht, de Noord-Amerikaanse bevers en Euraziatische bevers bouwen dammen van modder en twijgen langs rivieren.