De Mississippi is thuisbasis van een verscheidenheid van aquatische planten en dieren in een complexe, onderling verbonden ecosysteem. Waterplanten kunnen voorzien van voedsel en onderdak aan vele verschillende soorten in de rivier, en zo klein als de eencellige algen. De Mississippi biedt een heel scala van dieren, van vis, kikkers en andere ongewervelden.
Algen
Volgens de Iowa Department of Natural Resources, de Mississippi speelt gastheer voor twee belangrijke types van algen: groen en blauw-groen. Groene algen zijn de biologische basisonderdeel van een gezond ecosysteem; ze maken de grote kolonies die het water een groenige cast geven kunnen. Blauw - groene algen minder wenselijk zijn en worden beschouwd als een hinder-algen. Ze kunnen gekoppeld gestresst ecosystemen en leiden tot onaangename smaken in vis of doden van hele bevolkingen.
Kroos
Deze gemeenschappelijke vrij zwevende plant heeft een enkele kleine blad en wortels die bengelen in het water opzuigen van voedingsstoffen. Zoals aangegeven door zijn naam, is kroos een belangrijke voedselbron voor veel watervogels.
Waterlelies
Witte waterlelies zijn een gemeenschappelijke site in de Mississippi-rivier, en bestaat uit grote, drijvende bladeren met een leerachtige structuur. Ze produceren grote witte bloemen op de top van de bladeren, en zijn geworteld in de modder hieronder.
Rivierkreeft
Ook wel langoesten of crawdads genoemd, lijken deze schaaldieren op kleine kreeften. Ze zijn voornamelijk onder feeders en consumeren van leavings van andere dieren, carrion en kleine dieren. Zowel inheemse en invasieve rivierkreeft leven in de Mississippi-rivier.
Meerval
Channel catfish zijn een gemeenschappelijk gezicht in de Mississippi-rivier. Zij zijn de talrijkste soort meerval. Deze vissen kunnen groeien tot verrassende maten, en houden voornamelijk aan de bodem van de rivier. Ze zijn opmerkelijk vanwege hun neiging om te staken van vele verschillende soorten aas, maar ze dient zelden worden gegeten vanwege het gevaar van verontreiniging PCB (polychloorbifenylen bifenyl).
Luipaardkikker
Deze gevlekte kikkers heten ook weide kikkers. Ze leven in en rond de Mississippi rivier. Zij dienen vaak als een soort van de milieu-indicator als gevolg van hun gevoeligheid voor verontreinigende stoffen en contaminanten. Ze besteden het merendeel van hun tijd langs de marges van beken en andere waterlichamen, en eten vooral insecten, geleedpotigen en andere ongewervelden.
